Оформление скидок в счете-фактуре

Добрый день, уважаемые специалисты! Наша организация оказывает услуги. Стоимость услуг для каждого клиента складывается своя- в зависимости от объемов,суммы предоплаты и др. может быть предоставлена скидка. Для наглядности выставляем клиентам счета , где сумма скидки идет отдельной строкой с "минусом"и в стр."итого" по счету сумма к оплате стоит уже за минусом этой скидки. Если на основании такого счета оформлять акт выполненных работ и сч.фактуру- там тоже будут стоять отрицательные значения. Но ведь отрицательные величины не могут быть в сч.фактуре? как правильно оформить первичные документы для клиентов? За ранее спасибо!