Статья 346.18. Налоговая база 6. Налогоплательщик, который применяет в качестве объекта налогообложения доходы, уменьшенные на величину расходов, уплачивает минимальный налог в порядке, предусмотренном настоящим пунктом.
Соответственно, если у Вас база "Доходы", то при их отсутствии, ничего уплачивать не надо. Сдаете нулевую декларацию.
Заполнить, проверить и сдать декларацию по ЕСХН через интернет