Как оформить иностранца для проведения семинара по проекту в иностранной некомерческой организации?

Добрый день!
Видимо трудовой договор с этим иностранцем заключать смысла нет.
Заключите с ним договор подряда на проведение конкретного семинара. Оплатой установите компенсацию расходов на проезд и проживание.
Только разберитесь с налогами (вопрос по налогам задайте в новой теме в соответствующем разделе).

Успехов!