Добрый день. Накажут. Очень дорого обойдется. Поэтому советую как можно скорее деятельность эту легализовать. Но Вы слишком кратки в своем вопросе. Речь, полагаю, о торговых точках или точках общепита? Деятельность переведена на ЕНВД или ИП работает по патенту? Обе точки в одном муниципальном образовании или в разных? Как давно ведется деятельность в том помещении, которое не показывали в отчетности?