НДС налогового агента при УСН не весь попадает в КУДиР

Добрый день, Алена.
1. Договор с поставщиком:"Аренда"
Документ: Поступление товаров и услуг (Покупка, комиссия)
Дт 26 – Кт 60.01
Дт 60.01 – Кт 76НА
документ Списание с расчетного счета"Оплата поставщику":
Дт 60.01 – Кт 51
На основании документа Списание с расчетного счета вводим документ Счет-фактура выданный, код вида операции 06:
Дт 76НА – Кт 68.32
документ Списание с расчетного счета"Перечисление налога"
Дт 68.32 – Кт 51
2.Договор с поставщиком: USD, "Нерезедент"
Поступление товаров и услуг(Покупка, комиссия)
Дт 20.1 - Кт 60.21
Дт 60.21 – Кт 76.НА
Списание с расчетного счета (Основной счет. Прочие расчеты сконтрагентами)
Дт 57.02 - Кт 51
Поступление на расчетный счет ( Валютный счет Приобретение иностранной валюты)
Дт 52 - Кт 57.02
Дт 91.02 – Кт 57.02 (Прочие поступления по текущим операциям)
Списание с расчетного счета (Валютный счет Оплата поставщику)
Дт 60.21 – Кт 52
Дт 91.02 – Кт 60.21 или Дт 60.21 – Кт 91.02 – курсовые разницы
На основании документа Списание с расчетного счета вводим документ Счет-фактура выданный, код вида операции 06.
Дт 76НА – Кт 68.32
документ Списание с расчетного счета"Перечисление налога"
Дт 68.32 – Кт 51
3. Договор с поставщиком:"Реализация имущества"
Поступление товаров и услуг (Оборудование)
Дт 08.04 – Кт 60.01
Дт 60.01 - Кт 76НА
Списание с расчетного счета. (Оплата поставщику)
Дт 60.01 - Кт 51
На основании документа Списание с расчетного счета вводим
документ Счет-фактура выданный, код вида операции 06.
Дт 76НА – Кт 68.32
Списание с расчетного счета. (Перечисление налога)
Дт 68.32 – Кт 51

Все именно в такой последовательности...
Пункт 3 не особенно беспокоит . Это разовая акция. А вот 1 и 2 очень...

Добрый день!
Спасибо большое за то, что так подробно и корректно описали ваши учетные операции. =d>

На вид ваши варианты отражения, в принципе, верны.
Но при УСН (Д-Р) большую роль играет то, чтобы система увидела оплату контрагенту или зачет аванса по контрагенту (например, арендодателю) до того, как вы будете регистрировать по платежу НДС в бюджет (Д68.32 К51) с указанием конкретного сч-фактуры налогового агента (по уже произведенному перечислению тому контрагенту, налоговым агентом которого вы являетесь).
При несоблюдении такой последовательности система, скажем так, пропускает момент, не видит, не цепляет.
Если вы реально оплачиваете НДС позже, чем аванс контрагенту, то всё должно подхватываться нормально.
Если оплаты проходят в один и тот же день, то проверьте время в документах. Поменяйте, если что, таким образом, чтобы платеж в бюджет был позже.