Переплата по НДС

Здравствуйте!
1С:Предприятие 8.2 (8.2.19.83)
Бухгалтерия предприятия, редакция 2.0 (2.0.64.16)

Добрый день!
В этом случае образовавшаяся переплата будет вашим внереализационным доходом, т.е. Д 68.2 к 91.1, внесите её Бухгалтерской справкой.

Добрый день!
Т.е. даже если эта переплата висит в налоговой? Получается я делаю данную проводку, и т.к. это доход, еще с него и налог на прибыль платить придется?

Так ведь у вас-то этой переплаты нет! Она есть только в налоговой?  И чтобы она (параллельно с налоговой) появилась у вас, её необходимо восстановить в учете.
То есть, если вы согласны с этой переплатой в налоговой, значит когда-то у вас в учете что-то было отражено неверно, это нужно исправить.
Для этого допустимы 2 варианта: 
1) Ищите ошибку у себя: как и когда возникла эта разница (сверьтесь с налоговой детально по декларациям и уплатам)
2) Принимаете создавшуюся ситуацию как факт того, что у вас неверно, а в налоговой - верно. Тогда и отражаете у себя этот внереализационный доход.

Но что-то у меня смущают ваши вопросы, возникает подозрение, что вы не совсем до конца сверились в налоговой....

Здравствуйте!
Не, мы с ИФНС, как положено, заказали акты сверок. Все переплаты небольшие, что были все у нас с ними одинаково. А вот по НДС когда-то подавалась корректировка и там получилась переплата. Я поняла, что все проводим бух. справкой. Однако, не пойму, налог на прибыль с этой суммы платить надо????

Конечно!
Нельзя бюджет обижать!  Вы же доход получили? Получили! Платите...

А в 1С я должна буду написать ДТ 68.02. не принято к зачету?

Почему?
Это - налог уплаченный заранее.