ГСМ при перевозке своего и чужого груза

Добрый день!
Когда Вы задаёте вопрос, не забывайте, пожалуйста, о правилах форума. Напомню: мы стремимся создать на нашем форуме доброжелательную атмосферу. Поэтому у нас принято здороваться, а также говорить "спасибо" и "пожалуйста". Уважительное отношение к форумчанам, экспертам и модераторам - требование правил форума.

Давайте разбираться по-порядку. Кому нужен, кому не нужен НДС - в данном случае вторично. Первично же - оформление договорных взаимоотношений.

Вот здесь давайте остановимся подробнее.
Какое - какому, во-первых?
Во-вторых, на каких условиях (каков срок аренды по договору)?
Акт приема-передачи ТС при заключении договора аренды оформлен (а должен быть оформлен обязательно!)?

Вот эту фразу я просто не поняла. Всегда считала, что груз везут оттого, что покупателям нужен товар (и они его купили).

Полагаю, вставив в предложение выделенные мною слова, Вы сами подтвердили понимание, что в этом моменте не все в порядке.
С какой стати "от другого предприятия" (опустим сейчас речь о грузоотправителе)? Разве договор аренды в этот момент прекратил свое действие? На каком основании? Кто-то из уполномоченных лиц от каждого предприятия ездил в пункт погрузки-разгрузки для приема-передачи автомобиля обратно владельцу? Полагаю, что нет.
Поэтому новый груз (попутный, обратный - называйте, как угодно) везет все то же предприятие, что и везло до этого. Ничего не изменилось, кроме того, что "туда" ехал свой груз, а "обратно" - чужой. И на перевозку чужого груза должен быть оформлен с заказчиком услуги договор грузоперевозки.
Когда везли свой товар - вполне укладывались в свою систему налогообложения (ОСНО или УСН).
А вот когда повезли чужой - с огромной долей вероятности попали на ЕНВД. И в течение 5 дней с момента первого подобного рейса должны были встать в ИФНС на учет как плательщик ЕНВД.

Горючее-то в баке все свое - даже не сомневайтесь!
Но вот делить его все же придется: для целей раздельного учета при совмещении налоговых режимов.
Но это уже тема совсем иного обсуждения.

Завод и АТП - взаимосвязанные лица?
И Вы не ответили на мои вопросы:

Ну вот видите, появились подробности и ситуация выглядит теперь уже совсем иначе.
Хотя не все ясно и до сих пор.
На будущее: не надейтесь, что отвечающим все заранее понятно - описывайте сразу ситуацию максимально подробно. Это, кстати, предусмотрено и правилами форума.
И, кстати, Вы-то чей именно учет ведете?
Раз Завод и АТП планируется объединить, делаю вывод, что на текущий момент это разные организации.

Думаю, что здесь речь вовсе не о договоре аренды. Завод заказывает АТП услугу доставки собственной продукции. Должен быть заключен договор грузоперевозки. АТП груз перевозит, акт выполненных работ предоставляет, завод услугу оплачивает - на том отношения завершены. ДТ в баке принадлежит АТП. Стоимость ГСМ включена в стоимость услуги перевозки.

И здесь та же самая история. Только договор перевозки заключен между АТП и "каким-нибудь" ИП. Горючее в баке по-прежнему принадлежит АТП.
Делить ничего не надо.
Написала так, как должно быть. Простые и понятные договорные отношения.
Помню про НДС. Те "выверты", которые вы (в данном случае имею в виду не лично Вас - надеюсь, это понятно) пытаетесь изобразить с помощью "договора аренды на один рейс", заправки бака "за счет завода" по-русски называются "налоговая схема"; являются, как правило, противозаконными и не обсуждаются на страницах нашего форума. См. опять же правила форума.

Давайте договоримся так:
Вы завтра уточните, какие именно договорные отношения существуют между АТП и заводом. Договоры почитаете внимательно. Посмотрите, какая первичка оформляется обычно. Напишете здесь, что выяснить удастся.
А потом уже продолжим более предметное обсуждение вопроса.

Да, и еще про АТП: в организации более 20 автомобилей? Или в УК есть доля юрлиц?
Проясняю на всякий случай, в связи с чем и насколько обоснованно не применяется ЕНВД.