Можно ли в личном кабинете ЕГАИС вручную вести учет реализации пива для ООО?

Добрый день!
В личном кабинете ЕГАИС журнал розничных продаж формируется только из актов списания с причиной "реализация", которые Вы отправили в ЕГАИС. Любые документы ЕГАИС отправляются только через программу УТМ (универсальный транспортный модуль). Можно вручную составлять акты в каком либо редакторе и отправлять в УТМ, а оттуда они сами уйдут в ЕГАИС. В техническом описании УТМ (скачать из личного кабинета ЕГАИС) написано как это делать. Но это очень трудоемкий процесс, гораздо проще это делать в какой-то программе. А затем программа их отправит в УТМ , а УТМ в ЕГАИС.
УТМ шифрует файлы ключом перед тем как их отправить в ЕГАИС

Магазин Алко, то есть в принципе не обязательно иметь кассу, совместимую с ЕГАИС и покупать доп. оборудование в виде сканера и принтера чеков с QR-кодом?

Для пива не нужно печатать чеки с QR-кодом, в котором отражается информация для ЕГАИС. Если Вы не освобождены от онлайн-касс до 01.07.2019, то Вам надо ставить ее с 01.07.2018. До 01.07.2019 освобождены ИП без работников на ЕНВД или патенте .
Если у Вас будет онлайн-касса , то она будет печатать чеки для налоговой с QR-кодом, в котором информация предназначена только для налоговой. Если будет сканер  для чтения одномерного штрих-кода и в программе будет вестить база пива, то тогда удобнее заносить в акт списания продаваемое пиво. Если будете работать без сканера, то тогда для составления акта проданного пива надо будет где-то вручную писать, что продали, а затем из остатков ЕГАИС выбирать проданное пиво и заносить в акт, т.е. этот процесс более трудоемкий.