Регистрация счета-фактуры в книге покупок

Положения данного пункта применяются в отношении товаров, по которым налоговый вычет производится при наличии документов, подтверждающих уплату сумм налога на добавленную стоимость.

Например, при приобретении на территории РФ товаров у иностранных лиц российская организация, исполняя обязанности налогового агента (п. 2 ст. 161 НК РФ), в случае частичной оплаты за принятые на учет товары иностранному лицу должны регистрировать счет-фактуру в книге покупок по мере перечисления денежных средств с пометкой "частичная оплата".
Или же иная ситуация - покупатель возвращает продавцу ранее оприходованный и оплаченный товар. Налоговые вычеты в таком случае применяются на основании п. 5 ст. 171 НК РФ. Покупатель должен выставить счет-фактуру по возвращаемым товарам продавцу, который, возвращая деньги покупателю, регистрирует ее в книге покупок по мере возврата ранее полученной оплаты.

Ну и в дополнение к ответу nicol011160 , при авансовых расчетах тоже имеет место быть выставление счетов - фактур на суммы перечисленных авансов, соответственно - регистрация таких счетов - фактур в книге покупок (в случае перечисления аванса) или в книге продаж (в случае получения авансов).

При частичной оплате принятых на учет товаров (выполненных работ, оказанных услуг) регистрация счета-фактуры в книге покупок производится по каждой сумме, перечисленной продавцу в порядке частичной оплаты. В этом случае в книге покупок у каждой суммы необходимо сделать пометку "частичная оплата". Следовательно, регистрировать такой счет-фактуру в книге покупок необходимо столько раз, сколько раз по нему была произведена оплата, до его полной оплаты. Отметим, что регистрация в книге покупок счетов-фактур с одинаковыми реквизитами допускается только в случаях перечисления средств в порядке частичной оплаты и только в случаях, когда для применения налогового вычета необходимо выполнить условие фактической оплаты товаров (работ, услуг) (п. 9 Правил)."ГроссМедиа", 2008

Это было до 2008 года, когда НДС считали не только "по отгрузке", но и "по оплате". Согласно действовавшей редакции до 01.01.2008г. этого постановления НДС к возмещению принимался только после оплаты (частичной оплаты).

но редакция-то действующая, я специально посмотрела. и, честно говоря, озадачилась.

Во втором разделе в п.8 написано: "Счета-фактуры, полученные от продавцов, подлежат регистрации в книге покупок по мере возникновения права на налоговые вычеты в порядке, установленном статьей 172 Налогового кодекса Российской Федерации ". А вот уже в этой статье указываются условия принятия НДС к вычету (до 2008 г. одним из обязательных условий была оплата).