В КУДиР при УСН (15%) при отражении расходов не выделен НДС: является ли это грубым нарушением?

Добрый день.
Это во многом будет зависеть от требовательности проверяющего инспектора. С одной стороны, включение входящего НДС в стоимость ТРУ на расчёт налоговой базы чаще всего и не влияет, но, с другой стороны, по формальным признакам все основания для наказания есть - посмотрите письмо Минфина от 05.09.2014 № 03-11-06/2/44783 и описание грубой ошибки в ст. 120 НК РФ.