Начисление НДС на сумму недоплаты по контракту

Заказчик перечислил полную стоимость контракта, а банк-корреспондент снял свою комиссию с этих денег. На момент закрытия контракта возвращать эту сумму никто не собирается. Поэтому я ее закрываю прибылью, по курсу на день закрытия контракта. Но при этом увеличивается сумма выручки ко контракту, а НДС не бьется.

Контракт на работу, конечный продукт сертификат соответствия.

Я так понимаю, что контракт на импорт услуг?

Да.

Извените ошиблась если Заказчик не Вы значит это экспорт. Теперь возникает вопрос в какой стране у нас Заказчик? В Беларуссии? И еще вопрос а какой банк заказчика или Ваш снял комиссиию?

Это не Белоруссия. Больше Европа. А комиссию снял банк-корреспондент, промежуточный банк между нами и ими.

Вообще то банки должны перечислять сумму указанную в поручении на оплату полностью! Но думается мне что промежуточный банк где то за границей и бороться с этим трудно. Да и подтвердить оплату по контракту будет сложно. А вот с НДС еще сложнее! Сумма НДС Вами уже определена контрактом и на деле у Вас недоплата по контракту. Т.Е. получается что у Вас за заказчиком получается Дт сальдо. Закрыть прибылью Вы это не можете. Как у нас дебиторка списывается? Если только у Вас есть какие то документы подтверждающие списание комиссии и что именно Вы должны нести расходы по таким комиссиям. А так Вы ничего не докажете. Списание дебиторки за счет прибыли сразу (без 3-х летнего ожидания) налоговая навряд ли примет.

Да, есть над чем подумать.

Выручка, я так понимаю, считается с отгрузочных документов (в Вашем случае, актов выполненных работ). Поэтому как она может увеличиться в связи с недоплатой, непонятно. Собственно, и НДС оттуда же. А уж как Вы закроете оплату - другой вопрос!